木耳用凉水泡发时不宜超过3小时，用温水泡一般1个小时即可。泡发时加入足量的水，选个合适的碗，避免泡发时不够装。让木耳吸足水分，从而恢复到生长时的形态，吃起来的口感也比较好。若是在天热的时候，还要每隔几个小时换一次水，以免滋生有害的物质。如当天吃不完的，可更换泡木耳的凉水，然后沥干水分，将木耳放入密封性良好的保鲜盒中，然后放入冰箱冷藏，可延长至2天内食用不变质，如超过2天，发现干木耳有异味、糜烂等异样的应弃食扔掉。在泡发木耳前，还要注意将木耳的表面清洗干净，否则泡发的时间长了，容易滋生对人体有害的毒素，还要尽量一次性将它吃完，否则放久了容易产生毒素。
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